MAN 1 Magetan tidak hanya fokus pada pembelajaran akademik, tetapi juga memberikan ruang bagi siswa untuk mengembangkan minat, bakat, serta keterampilan melalui berbagai kegiatan ekstrakurikuler. Beberapa pilihan ekstrakurikuler yang tersedia antara lain:

Bidang Keagamaan

• Pramuka

• PMR (Palang Merah Remaja)

• Tari Sufi

• Banjari

• Nasyid

• Qiro’ah

• Majelis Muroqobah

Bidang Seni & Kreativitas

• Musik

• Singer

• Kaligrafi

• Desain Grafis

• Broadcasting

Bidang Olahraga & Bela Diri

• Olahraga (Futsal, Voli, Basket, Badminton, dan lainnya)

• Seni Bela Diri Pencak Silat

Bidang Akademik & Literasi

• Jurnalistik

Dengan berbagai kegiatan tersebut, diharapkan siswa MAN 1 Magetan dapat mengasah potensi diri, membentuk karakter yang positif, serta meraih prestasi baik di bidang akademik maupun non-akademik.